Состав коллектива

  • Рыжкова Анастасия Сергеевна, м.н.с. в лаборатории постгеномной нейробиологии, ИЦиГ СО РАН.
  • Смирнов Александр Васильевич, к.б.н., м.н.с. в лаборатории генетики развития, заведующий лабораторией 3D-генетики разрывов, ИЦиГ СО РАН. Руководитель

Аннотация

Белки SMC-комплексов, к которым относят когезин, конденсины-I/II, не только формируют топологическую структуру хромосом, но и участвуют в репарации двухцепочечных разрывов ДНК (DSB). Предположительно, они ограничивают мобильность концов DSB, предотвращая перестройки. Однако, для более ранних работ характерна небольшая выборка локусов, для которых охарактеризовано влияние упомянутых белков на частоту делеций. Кроме того, бекли SMC-комплексов могут иметь разное влияние на репарацию DSB, в зависимости от расстояния между двумя разрывами. В данной работе при помощи системы CRISPR/Cas9 мы вносим разрывы в разных эпигенетических контекстах и на разном расстоянии друг от друга – 100-200 п. о.; 2-5 тыс. п. о.; 100-300 тыс. п. о.

Финансовая поддержка

  • Грант РНФ № 22-74-00084. «Роли SMC-комплексов когезина и конденсинов в репарации отдаленных двухцепочечных разрывов ДНК в эмбриональных стволовых клетках мыши». Руководитель проекста - Смирнов Александр Васильевич. 2022-2024г